1、普通的燃氣鍋爐、燃油鍋爐、生物質鍋爐、環保燃煤鍋爐的熱源是利用介質燃燒（煤、油、燃氣等）獲得，而余熱鍋爐的熱源是利用工業燃燒的余熱廢熱（工業爐的燃燒溫度較高廢氣余熱再次利用），普通的燃料鍋爐都是鍋爐，而余熱鍋爐只有鍋，沒有燃燒的爐；

2、工業鍋爐的結構有點復雜和輔助設備較多，而余熱鍋爐結構相對比較簡單，工業鍋爐種類多，余熱鍋爐現在比較多的是直通式余熱鍋爐；

3、工業鍋爐運行的各參數（壓力、水位、溫度）等容易控制因為燃燒可以控制，而余熱鍋爐的運行參數不易控制的，在運行中余熱鍋爐的熱源是隨工業爐的燃燒周期而變化。